HS Probe qPCR Mix with UDG
Cat. #:P2301,P2302,P2303,P2304,P2305
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
HS Probe qPCR Mix with UDG是用于探針法實(shí)時(shí)定量PCR的2×濃縮預(yù)混液,使用時(shí)只需加入模板、引物和探針即可進(jìn)行反應(yīng)。本品含有類抗體技術(shù)修飾的熱啟動(dòng)酶Hotstart Taq DNA聚合酶,配合東盛特制的Real Time PCR Buffer,不僅有效抑制引物二聚體和其他非特異性擴(kuò)增,而且能夠提高擴(kuò)增效率,可以進(jìn)行高靈敏度高特異性的PCR反應(yīng)。該試劑引入了 dUTP/UDG 防污染系統(tǒng),可以在PCR反應(yīng)前清除含dUTP的PCR產(chǎn)物,有效避免因擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染對(duì)定量的影響。本品在寬廣的定量域內(nèi)具有良好的線性關(guān)系,對(duì)靶基因定量準(zhǔn)確、可信度高,重復(fù)性好。本品可搭配TaqMan等各類熒光探針使用,與常見定量PCR儀完美兼容,如ABI、Roche、Bio-Rad等。
產(chǎn)品組成
Component | P2301 | P2302 | P2303 | P2304 | P2305 |
2× HS Probe qPCR Mix with UDGa | 1 ml | 1 ml×5 | 1 ml×10 | 1 ml×50 | 1 ml×100 |
超純水 | 1 ml | 1 ml×5 | - | - | - |
a 包含Hotstart Taq DNA聚合酶,dNTP/dUTP Mix,UDG(Uracil-DNA Glycosylase,尿嘧啶DNA糖基化酶)及反應(yīng)緩沖液等。
保存條件
-20℃保存2年,4℃可短期保存。
質(zhì)量控制
純度檢測(cè):經(jīng)質(zhì)量檢測(cè),產(chǎn)品不含脫氧核糖核酸內(nèi)切酶、脫氧核糖核酸外切酶和核糖核酸酶污染。
功能檢測(cè):經(jīng)不同來源的模板和引物檢測(cè),產(chǎn)品具有優(yōu)秀的特異性、靈敏性及可重復(fù)性等。
應(yīng)用舉例
1. 配制反應(yīng)體系
請(qǐng)于冰上配制以下反應(yīng)體系:
Component | Volume | Final concentration |
DNA template[1] | 1-4 μl | Variable |
Forward primer (10 μM)[2] | 0.4 μl | 0.2 μM |
Reverse primer (10 μM)[2] | 0.4 μl | 0.2 μM |
2× HS Probe qPCR Mix with UDG | 10 μl | 1× |
Probe (10 μM)[3] | Variable | 0.1-0.5 μM |
ddH2O | Variable | - |
Total volume[4] | 20 μl | - |
[1] DNA模板建議用量(20 μl體系):1-10 ng cDNA,或10-100 ng gDNA。加樣體積不宜過小,以免造成較大的誤差,但未稀釋的cDNA不宜超過總體積的1/10。因此模板建議濃度(加樣前):cDNA 1-10 ng/μl,gDNA 10-100 ng/μl。
[2] 引物終濃度建議范圍:0.1-1.0 μM, 通常引物終濃度為0.2 μM效果較好。
[3] 使用探針的濃度與Real Time PCR擴(kuò)增儀、探針種類和熒光標(biāo)記物種類有關(guān),使用時(shí)請(qǐng)參照相關(guān)說明。通常探針終濃度在0.1-0.5 μM之間。
[4] 建議總體積不小于10 μl,以免造成較大的加樣誤差。具體體積范圍參考儀器說明。
注意:對(duì)于某些固定型號(hào)的儀器,需要添加ROX才能精確測(cè)定Ct值。由于ROX的使用體積較小,建議將ROX提前與qPCR Mix混勻使用。ROX用量參照具體儀器說明,下表僅供參考。
Instruments | ROX (100X) |
ABI PRISM 7000/ PRISM 7700/ 7300/ 7900HT/ Step One/ Step One Plus/ GeneAmp 5700 | 1-2% (High ROX) |
ABI 7500/ 7500 Fast/ ViiA 7/ QuantStudio 6/7/12K Flex; Agilent Stratagene Mx3000P/ Mx3005P/ Mx4000 | 0.2% (Low ROX) |
Bio-Rad CFX96/ CFX384/ iQ/ iQ5; MJ Research Opticon 2/ Chromo 4; Roche LightCycler 480/ 96; Corbett Rotor Gene G/ Q/ 3000/ 6000; Thermo PikoReal 96; Eppendorf MasterCycler ep realplex; Cepheid Smart Cycler | No ROX |
2. 設(shè)定反應(yīng)程序進(jìn)行qPCR反應(yīng)
兩步法程序示例如下:
Stage | Temperature | Time | Cycle |
UDG pre-treatment | 37℃ | 2 min | 1 |
Initial denaturation | 95℃ | 3 min | 1 |
Denaturation | 95℃ | 10 sec | 40 |
Annealing & Extension[1] | 60℃ | 30 sec |
[1] 儀器在此階段進(jìn)行信號(hào)采集。請(qǐng)根據(jù)儀器類型設(shè)置反應(yīng)時(shí)間。如需優(yōu)化溫度,建議在55-65℃范圍內(nèi)調(diào)整。
若反應(yīng)效果不佳,建議采用三步法擴(kuò)增程序。
經(jīng)典三步法程序示例如下:
Stage | Temperature | Time | Cycle |
UDG pre-treatment | 37℃ | 2 min | 1 |
Initial denaturation | 95℃ | 3 min | 1 |
Denaturation | 95℃ | 10 sec | 40 |
Annealing[1] | 60℃ | 15 sec | |
Extension | 72℃ | 20 sec |
[1] 儀器在此階段進(jìn)行信號(hào)采集。常用退火溫度在55-65℃之間。退火溫度一般設(shè)定為所用引物的Tm-5℃,若低于55℃,則以Tm值為退火溫度,一般不低于55℃。請(qǐng)根據(jù)儀器類型設(shè)置反應(yīng)時(shí)間。
3. 分析結(jié)果
觀察擴(kuò)增曲線;調(diào)整基線,計(jì)算Ct值;進(jìn)行相對(duì)或絕對(duì)定量。
注意事項(xiàng)
1 使用前Mix需要完全解凍,充分混勻。盡量避免多次反復(fù)凍融。短期使用可保存于4℃。
2 將(n+x)份反應(yīng)液混勻后再分注到n個(gè)單管中,可降低加樣誤差。(n為重復(fù)次數(shù),x為損耗量,一般為n的1/10)
3 ABI的定量?jī)x器大部分需要ROX校正管間差異,Bio-Rad的定量?jī)x器不需要ROX校正。具體儀器請(qǐng)參照其使用說明。
4 輕輕混勻反應(yīng)液,避免產(chǎn)生氣泡,氣泡會(huì)干擾熒光檢測(cè)??伤矔r(shí)離心去除氣泡。
5 引物的特異性、用量以及退火溫度是影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重要因素。務(wù)必設(shè)計(jì)特異性好的引物,隨實(shí)驗(yàn)結(jié)果適當(dāng)調(diào)整引物用量(0.1 μM-1.0 μM)——特異性較差時(shí)減少引物用量,或以3℃為增量提高退火溫度,擴(kuò)增效率較低時(shí)增加引物用量。
6 DNA模板的量應(yīng)小于500 ng/反應(yīng),過高的模板量會(huì)引起非特異性擴(kuò)增。應(yīng)根據(jù)模板類型與基因表達(dá)量適當(dāng)調(diào)整用量。
7 各類探針應(yīng)參照相應(yīng)的指南進(jìn)行設(shè)計(jì),并根據(jù)所用擴(kuò)增儀類型、探針種類和熒光標(biāo)記物種類等調(diào)整用量。