HS Probe qPCR Mix with UDG
Cat. #:P2301,P2302,P2303,P2304,P2305
產(chǎn)品簡介
HS Probe qPCR Mix with UDG是用于探針法實時定量PCR的2×濃縮預混液,使用時只需加入模板、引物和探針即可進行反應。本品含有類抗體技術修飾的熱啟動酶Hotstart Taq DNA聚合酶,配合東盛特制的Real Time PCR Buffer,不僅有效抑制引物二聚體和其他非特異性擴增,而且能夠提高擴增效率,可以進行高靈敏度高特異性的PCR反應。該試劑引入了 dUTP/UDG 防污染系統(tǒng),可以在PCR反應前清除含dUTP的PCR產(chǎn)物,有效避免因擴增產(chǎn)物的交叉污染對定量的影響。本品在寬廣的定量域內(nèi)具有良好的線性關系,對靶基因定量準確、可信度高,重復性好。本品可搭配TaqMan等各類熒光探針使用,與常見定量PCR儀完美兼容,如ABI、Roche、Bio-Rad等。
產(chǎn)品組成
Component | P2301 | P2302 | P2303 | P2304 | P2305 |
2× HS Probe qPCR Mix with UDGa | 1 ml | 1 ml×5 | 1 ml×10 | 1 ml×50 | 1 ml×100 |
超純水 | 1 ml | 1 ml×5 | - | - | - |
a 包含Hotstart Taq DNA聚合酶,dNTP/dUTP Mix,UDG(Uracil-DNA Glycosylase,尿嘧啶DNA糖基化酶)及反應緩沖液等。
保存條件
-20℃保存2年,4℃可短期保存。
質量控制
純度檢測:經(jīng)質量檢測,產(chǎn)品不含脫氧核糖核酸內(nèi)切酶、脫氧核糖核酸外切酶和核糖核酸酶污染。
功能檢測:經(jīng)不同來源的模板和引物檢測,產(chǎn)品具有優(yōu)秀的特異性、靈敏性及可重復性等。
應用舉例
1. 配制反應體系
請于冰上配制以下反應體系:
Component | Volume | Final concentration |
DNA template[1] | 1-4 μl | Variable |
Forward primer (10 μM)[2] | 0.4 μl | 0.2 μM |
Reverse primer (10 μM)[2] | 0.4 μl | 0.2 μM |
2× HS Probe qPCR Mix with UDG | 10 μl | 1× |
Probe (10 μM)[3] | Variable | 0.1-0.5 μM |
ddH2O | Variable | - |
Total volume[4] | 20 μl | - |
[1] DNA模板建議用量(20 μl體系):1-10 ng cDNA,或10-100 ng gDNA。加樣體積不宜過小,以免造成較大的誤差,但未稀釋的cDNA不宜超過總體積的1/10。因此模板建議濃度(加樣前):cDNA 1-10 ng/μl,gDNA 10-100 ng/μl。
[2] 引物終濃度建議范圍:0.1-1.0 μM, 通常引物終濃度為0.2 μM效果較好。
[3] 使用探針的濃度與Real Time PCR擴增儀、探針種類和熒光標記物種類有關,使用時請參照相關說明。通常探針終濃度在0.1-0.5 μM之間。
[4] 建議總體積不小于10 μl,以免造成較大的加樣誤差。具體體積范圍參考儀器說明。
注意:對于某些固定型號的儀器,需要添加ROX才能精確測定Ct值。由于ROX的使用體積較小,建議將ROX提前與qPCR Mix混勻使用。ROX用量參照具體儀器說明,下表僅供參考。
Instruments | ROX (100X) |
ABI PRISM 7000/ PRISM 7700/ 7300/ 7900HT/ Step One/ Step One Plus/ GeneAmp 5700 | 1-2% (High ROX) |
ABI 7500/ 7500 Fast/ ViiA 7/ QuantStudio 6/7/12K Flex; Agilent Stratagene Mx3000P/ Mx3005P/ Mx4000 | 0.2% (Low ROX) |
Bio-Rad CFX96/ CFX384/ iQ/ iQ5; MJ Research Opticon 2/ Chromo 4; Roche LightCycler 480/ 96; Corbett Rotor Gene G/ Q/ 3000/ 6000; Thermo PikoReal 96; Eppendorf MasterCycler ep realplex; Cepheid Smart Cycler | No ROX |
2. 設定反應程序進行qPCR反應
兩步法程序示例如下:
Stage | Temperature | Time | Cycle |
UDG pre-treatment | 37℃ | 2 min | 1 |
Initial denaturation | 95℃ | 3 min | 1 |
Denaturation | 95℃ | 10 sec | 40 |
Annealing & Extension[1] | 60℃ | 30 sec |
[1] 儀器在此階段進行信號采集。請根據(jù)儀器類型設置反應時間。如需優(yōu)化溫度,建議在55-65℃范圍內(nèi)調(diào)整。
若反應效果不佳,建議采用三步法擴增程序。
經(jīng)典三步法程序示例如下:
Stage | Temperature | Time | Cycle |
UDG pre-treatment | 37℃ | 2 min | 1 |
Initial denaturation | 95℃ | 3 min | 1 |
Denaturation | 95℃ | 10 sec | 40 |
Annealing[1] | 60℃ | 15 sec | |
Extension | 72℃ | 20 sec |
[1] 儀器在此階段進行信號采集。常用退火溫度在55-65℃之間。退火溫度一般設定為所用引物的Tm-5℃,若低于55℃,則以Tm值為退火溫度,一般不低于55℃。請根據(jù)儀器類型設置反應時間。
3. 分析結果
觀察擴增曲線;調(diào)整基線,計算Ct值;進行相對或絕對定量。
注意事項
1 使用前Mix需要完全解凍,充分混勻。盡量避免多次反復凍融。短期使用可保存于4℃。
2 將(n+x)份反應液混勻后再分注到n個單管中,可降低加樣誤差。(n為重復次數(shù),x為損耗量,一般為n的1/10)
3 ABI的定量儀器大部分需要ROX校正管間差異,Bio-Rad的定量儀器不需要ROX校正。具體儀器請參照其使用說明。
4 輕輕混勻反應液,避免產(chǎn)生氣泡,氣泡會干擾熒光檢測??伤矔r離心去除氣泡。
5 引物的特異性、用量以及退火溫度是影響實驗結果的重要因素。務必設計特異性好的引物,隨實驗結果適當調(diào)整引物用量(0.1 μM-1.0 μM)——特異性較差時減少引物用量,或以3℃為增量提高退火溫度,擴增效率較低時增加引物用量。
6 DNA模板的量應小于500 ng/反應,過高的模板量會引起非特異性擴增。應根據(jù)模板類型與基因表達量適當調(diào)整用量。
7 各類探針應參照相應的指南進行設計,并根據(jù)所用擴增儀類型、探針種類和熒光標記物種類等調(diào)整用量。