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分析PCR擴增的重要標準

欄目:技術(shù)支持
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什么是PCR實驗的靈敏度?

靈敏度指的是PCR擴增反應能夠檢測到目的基因的最小值。研究結(jié)果表明,影響PCR擴增效率的因素,如模板的復雜程度與完整性、引物的純度及其與模板的結(jié)合效率、反應溫度、DNA聚合酶的熱穩(wěn)定性與擴增性能、反應緩沖液的離子組成(主要指陽離子)、反應優(yōu)化劑等等,都決定了PCR實驗的檢測靈敏度。在最佳的擴增條件下,常規(guī)PCR反應能夠檢測到的pg(10-12g)數(shù)量級的目的基因。對于一個特定的目的基因而言,模板與引物通常都是已經(jīng)限定好的因素。因此,選擇什么樣的PCR反應體系(包括DNA聚合酶與反應緩沖液等)就是研究者提高PCR實驗靈敏度的關(guān)鍵因素了。

與實驗室自配的PCR擴增體系相比,東盛的Taq Mix對反應緩沖液中的成分進行優(yōu)化,并加入了適當比例的反應增強劑(PCR Enhancer),提高了DNA聚合酶的熱穩(wěn)定性,顯著降低模板的二級結(jié)構(gòu)對PCR擴增性能的影響,使得DNA聚合酶處于最適活性狀態(tài),從而獲得了比自配體系更高的檢測靈敏度。即時反應體系中只有幾個目的基因的拷貝,也能輕松檢測。

什么是PCR實驗的特異性?

特異性指的是在PCR擴增過程中,專一性地擴增目的片段而非其他片段的性能。在PCR實驗本身的靈敏度很高,且實驗條件未充分優(yōu)化的情況,通常會在目的片段出現(xiàn)的同時伴隨有其他的雜帶,即發(fā)生非特異性擴增的現(xiàn)象。模板、引物性質(zhì)及質(zhì)量、反應條件的控制等均會影響PCR擴增的特異性。近年來的研究結(jié)果表明,緩沖液的品質(zhì)(如離子種類與組成,反應優(yōu)化劑等)對保證PCR的特異性擴增起著不可忽視的作用。一般的緩沖液中調(diào)節(jié)氫鍵作用的鹽只有KCl,而東盛HSTM TaqMix的緩沖體系通過反應優(yōu)化劑以及KCl/(NH4)SO4鹽離子體系的平衡調(diào)節(jié),顯著提高了PCR擴增的特異性,降低背景。    

PCR實驗的靈敏度與特異性是一對此長彼消的特性,這也決定我們實驗體系調(diào)節(jié)實際就是找到適合實驗的靈敏度與特異性的平衡點。由于PCR體系中的眾多成分,使得組合較多,篩選工作繁雜。東盛基于靈敏度與特異性分別設(shè)計了PCR Mix和HS Taq Mix,幫您確定大的平衡點,如果您需要更細致的平衡點,請選擇相應的Mix Kit系列進行微調(diào)。