背景介紹:
剛發(fā)現(xiàn)外泌體時(shí),這種比多泡體還要小的細(xì)胞外囊泡被視為細(xì)胞外排出的代謝垃圾,但隨著對(duì)這種細(xì)胞外囊泡不斷地深入研究,發(fā)現(xiàn)這種細(xì)胞外囊泡在細(xì)胞之間的通訊交流中發(fā)揮著極其重要的作用。
外泌體是什么?
外泌體是機(jī)體所有活細(xì)胞分泌的一種直徑約為30-150nm的細(xì)胞外囊泡,廣泛存在于各種生物體液(血液、尿液、母乳、唾液、胸水、腹水、腦脊液等)中。它們由蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、核酸的特定成分組成,可以將信號(hào)傳遞給受體細(xì)胞,從而介導(dǎo)細(xì)胞間的通訊。外泌體在多種生物學(xué)功能中發(fā)揮著重要作用,包括參與RNA、蛋白質(zhì)、酶和脂質(zhì)等生物分子的轉(zhuǎn)移,以及各種生理和病理過(guò)程的調(diào)節(jié)。
外泌體屬于細(xì)胞外囊泡的一種,根據(jù)直徑大小以及釋放機(jī)制的不同可將細(xì)胞外囊泡主要分為外泌體、微囊泡、凋亡小體,它們都參與細(xì)胞間信息傳遞,但目前對(duì)于外泌體的研究最多。
表 外泌體與其他細(xì)胞外囊泡的區(qū)別
分類 | 外泌體 | 微囊泡 | 凋亡小體 |
直徑 | 30-150nm | 100-1000nm | 500-4000nm |
密度 | 1.1-1.18g/mL | 1.02-1.22g/mL | 1.16-1.28g/mL |
來(lái)源 | 細(xì)胞內(nèi)的多泡小體與細(xì)胞膜融合后,其內(nèi)的小泡釋放到細(xì)胞外 | 細(xì)胞膜出芽形成 | 凋亡時(shí)細(xì)胞膜皺縮內(nèi)陷,分割包裹胞質(zhì)形成的泡狀小體 |
內(nèi)含物 | mRNA、miRNA、非編碼RNA、蛋白(細(xì)胞質(zhì)、膜)、MHC | mRNA、miRNA、非編碼RNA、蛋白 | 核組分、DNA、細(xì)胞器 |
蛋白標(biāo)志物 | Alix、TSG101、HSC70、CD63、CD81、CD9 | Selectin、integrins、CD40、MMP | Histones |
功能 | 細(xì)胞內(nèi)通訊、細(xì)胞間物質(zhì)交流 | 細(xì)胞內(nèi)通訊、在細(xì)胞間運(yùn)輸遺傳物質(zhì) | 調(diào)節(jié)病理和生理過(guò)程 |
圖 外泌體與其他細(xì)胞外囊泡
外泌體的結(jié)構(gòu)組成:
外泌體具有脂質(zhì)雙分子層結(jié)構(gòu),由膽固醇、鞘磷脂和磷酸甘油酯等成分共同組成,在其脂質(zhì)雙分子層的表面附著有粘附分子、主要組織相容性復(fù)合體(major histocompatibility complex,MHC)、大量的特定蛋白質(zhì),包括四跨膜蛋白、熱休克蛋白等等和各種特定的配體(CD9、CD63、CD81等)。在外泌體的內(nèi)腔中還攜帶各種生物活性物質(zhì),包括核酸、某些酶類、蛋白分子、細(xì)胞代謝物等,核酸例如信使核糖核酸(messenger ribonucleic acid,mRNA)、微小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)、脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)和長(zhǎng)鏈非編碼核糖核酸(Longnon-coding ribonucleic acid,LncRNA)等。
圖 外泌體的結(jié)構(gòu)組成
外泌體的功能:
外泌體的功能起決于其所來(lái)源的細(xì)胞類型。外泌體能夠?qū)⒑怂?、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)在內(nèi)的多種生物活性分子從供體細(xì)胞轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞,介導(dǎo)細(xì)胞間通訊和分子轉(zhuǎn)運(yùn);并且外泌體可以由所有類型的活細(xì)胞分泌,在體液中廣泛分布。它可參與機(jī)體免疫應(yīng)答、抗原提呈、細(xì)胞遷移、細(xì)胞分化、細(xì)胞遷移、腫瘤侵襲等方面,因此外泌體在生理病理標(biāo)志物和藥物遞送方面有巨大的應(yīng)用潛力。
外泌體提?。?/span>
進(jìn)行外泌體研究,首先要將其從樣本中提取出來(lái)。目前已有許多基于外泌體物理及生化特性的分離方法,傳統(tǒng)方法包括超速離心、密度梯度離心、超濾、尺寸排阻色譜(size-exclusionchromatography,SEC)、聚合物沉淀法、免疫親和層析,還有一些新的微流體技術(shù)、商業(yè)試劑盒。
圖 外泌體分離純化方法合集
超速離心:
超速離心法是最常用也是分離外泌體的“金標(biāo)準(zhǔn)”方法。其原理是利用溶液顆粒大小和密度導(dǎo)致沉降速率不同,來(lái)分離不同組分。該方法包含以下步驟:低速離心去除細(xì)胞和凋亡碎片;其次以更高離心力消除更大囊泡;最后高速離心沉淀外泌體。該方法操作簡(jiǎn)便,可以擴(kuò)展為大規(guī)模外泌體制備。在過(guò)去30年中,超速離心法被廣泛應(yīng)用于從細(xì)胞培養(yǎng)基、血清、體液中分離外泌體。但是該方法特異性不強(qiáng)、可混有分子量相近的蛋白質(zhì),同時(shí)高速離心力可能破壞外泌體膜泡影響下游分析。
圖 超速離心法分離外泌體
密度梯度離心:
密度梯度離心利用顆粒大小與密度差異對(duì)外泌體進(jìn)行分離。密度梯度離心會(huì)預(yù)先使用蔗糖或碘克沙醇制作密度梯度。樣品從頂部加入離心管,在離心過(guò)程中逐漸自上而下沉降,在一定密度區(qū)間聚集。外泌體通常密度范圍為1.1~1.2g/mL。該方法的局限性是分離樣本容量受到密度區(qū)帶寬度的限制,因此密度梯度離心不便于處理大樣本。
圖 密度梯度離心分離外泌體
超濾:
超濾是基于外泌體尺寸進(jìn)行分離的方法。根據(jù)膜孔的尺寸和截留分子量,將小顆粒通過(guò)膜孔進(jìn)入濾液,大顆粒截留在膜表面。超濾的主要缺點(diǎn)為液體流動(dòng)方向平行膜孔方向,造成大顆粒堵塞膜孔,同時(shí)產(chǎn)生的剪切力也會(huì)使外泌體變形或裂解。
圖 超濾法純化外泌體
尺寸排阻色譜(SEC):
SEC原理為根據(jù)顆粒尺寸進(jìn)行分離。在色譜柱中填充多孔固定相,小顆??梢源┻^(guò)固定相中的空隙,因此沉降路徑變長(zhǎng),較大顆粒更晚沉降,因此可以分離尺寸差別較大的顆粒。通常SEC會(huì)先進(jìn)行超速離心預(yù)處理以此減少雜質(zhì)、提高純度。SEC最大的優(yōu)勢(shì)是可以很好的保留外泌體活性。
圖 尺寸排阻色譜(SEC)純化外泌體
聚合物沉淀法:
聚合物沉淀原理是利用超親水聚合物,如PEG結(jié)合溶液中水分子使溶質(zhì)溶解度降低進(jìn)而沉淀析出,最后通過(guò)低速離心獲得外泌體。可以廣泛用于各種樣品類型,如血液、培養(yǎng)基、尿液、腦脊液等。其優(yōu)點(diǎn)是可處理大樣本,產(chǎn)量較高。缺點(diǎn)是分離的外泌體會(huì)受到其他蛋白質(zhì)污染。
圖 聚合物沉淀法純化外泌體
免疫親和層析:
免疫親和層析基本原理通過(guò)配體與抗體特異結(jié)合進(jìn)而分離純化。一般用外泌體表面生物標(biāo)記物作為配體,如四跨膜蛋白超家族、囊泡轉(zhuǎn)運(yùn)分類內(nèi)涵體復(fù)合物、復(fù)合物相關(guān)蛋白??贵w吸附在磁珠、多孔二氧化硅單片板、膜親和過(guò)濾器上,溶液通過(guò)時(shí)可特異結(jié)合外泌體表面蛋白進(jìn)行分離純化。常見(jiàn)方法有基于微孔板的酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定與磁珠免疫捕獲。此類方法具有高特異性,并可以保證外泌體生物活性。
圖 磁珠法免疫捕獲外泌體
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